Die Finanzierung der Biologischen Station erfolgt im Rahmen der Förderrichtlinie Biologische Stationen NRW (FÖBS)zu etwa 60 % durch das Land Nordrhein-Westfalen und den Kreis Düren.

Weitere etwa 40 % werden mit Hilfe von Projektmitteln jährlich wechselnden Umfangs im Rahmen von EU-Förderprojekten (Interreg, Leader, Erlebnis.nrw oder LIFE+), regionalen Projekten (Landschaftsverband Rheinland (LVR)), Stiftungsmitteln (Sparkassen-Stiftung, HIT-Umweltstiftung) oder dem Verein zur Förderung des Naturschutzes im Kreis Düren finanziert.

Diese haben in den letzten Jahren zunehmend an Bedeutung gewonnen, denn sie ermöglichen der Station die Umsetzung z.B. von Artenschutz- und Großprojekten wie dem Projekt Netzwerk Biber und Grauammer.